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此后，日足提出将族长之位让给日向耀，却被日向耀拒绝了，在他看来，能掌控日向一族，让日向一族为自己办事就可以，当不当族长是完全无所谓的事。
日足见耀态度坚决，也就此放弃了，但此后，家族中每逢大事，他都必定会过来提前请示耀的意见，俨然一副视耀为家族太上长老的架势！
而日向耀在掌控了家族后，大蛇丸之前承诺给日向耀建立的两个实验室，设备也采购齐全了，之前的准备，是将这两个实验室建立在驻地附近，但如今日向耀回到了木叶，并且掌控家族，自然是要将实验室建立在家族中了。
对此，日足也没有表示反对，他甚至还专门派遣年轻的家族成员学习医疗忍术，以方便能在某些程度上帮到日向耀，在他看来，耀就是家族真正的未来和希望！
在大蛇丸提供的设备，日向一族提供的钱和人力的情况下，耀一直心心念念的实验室，总算是建好了。
方一建好实验室，他就从自己身上取了些细胞，来专门进行培养，并进行分析。
细胞培养技术，大蛇丸在这方面是极为擅长的，日向耀自然是能够拿到他的技术，并以此展开自己的研究。
他首先做的，就是希望能够以不同的细胞，培育出专门的器官出来，如此一来，当忍者因为受伤，而导致身体某些部分损坏时，就完全可以另外培养一份出来，以进行移植。
对于这一点，日足听完也是非常支持的，因为几次忍界大战，日向一族受伤的忍者并不少，缺胳膊少腿的大有人在，如果细胞培养成器官成功了，那么将可以让家族中那些失去忍者能力的人，重新成为忍者！
而日向耀第二项实验，就是涉及到他一直想尝试的，关于解开日向一族，乃至整个忍界秘密的实验——基因实验。
日向耀的右眼，在进化以后，其显微的能力，已然达到了看穿细胞核，乃至其中隐藏的染色体的程度。
在基因实验室中，他提取了多名忍者的染色体，最终发现，忍界的人与他前世的人类并不相同，其染色体共有24对。
其中前23对都差不多，男女共有的22对，一对则是区分了男女。
而最后的一对，按照日向耀的分析，不同的忍者，情况就大不一样了，不仅长短差别极大，甚至极其容易被查克拉改变，搞得日向耀都怀疑它是不是真正的染色体。
在分析这最后一对染色体时，日向耀发现，同族、同属性的忍者，这个染色体就具有某些相同的特性，拿日向一族来说，所有的成员都有部分染色体极其相似。
日向耀猜测，这部分染色体极有可能是与白眼有关的能力。
日向耀继续观察这部分染色体，却是发现这组成这部分染色体的基因也非常相似，那么能不能使用某种方法，将这部分基因进行编辑，加入到其他细胞的基因中，以此完成转基因手术，并培育出与日向一族白眼的能力呢？
日向耀一开始想着使用查克拉进行操纵，但发现他还是太年轻了，洞察到基因这个层次，已然是极限，想要将查克拉操纵提升到这一层次，几乎是不可能的。
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